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Southern blotting (E. Southern과 R. Davies가 1975 년에 개발)은 특정 질병의 유전자가 확인되는 주된 방법이다. 이를 위해 환자 세포의 DNA를 추출하여 제한 엔도 뉴 클레아 제 (또는 여러 개) 중 하나로 처리합니다. 생성 된 단편을 전기 영동하여 크기를 조절할 수 있습니다 (작은 조각은 겔의 세공을 통해 더 빨리 이동합니다). 그런 다음 단편을 니트로 셀룰로스 필터로 옮기고 (재 인쇄), 그 위에 방사성 표지 된 프로브가 쌓입니다. 프로브는 상보적인 서열에만 결합합니다. 그런 다음, 오토 라디오 그래피 (autoradiography)의 방법에 의해, 전기 기록상의 게놈 DNA의 원하는 단편의 위치가 결정된다.
표지 된 DNA 프로브 RNA 또는 DNA 제제와 혼성화 전에 제한 및 전기없이 고체 매트릭스에 가해 드립은 (각각 원형 또는 연장 된) 필터의 DNA 스폿의 구성에 따라 도트 슬롯 혼성화 불린다.